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荣耀手机已删除的短信可以通过以下几种方式进行恢复。
1、通过华为备份恢复：如果开启了华为云备份并且备份了短信，可以通过华为备份恢复数据，进入【设置】，选择【系统和更新】，找到【备份和恢复】，在备份记录中选择想要恢复的短信数据，点击恢复按钮进行恢复。
2、使用手机数据恢复软件：如【手机数据恢复精灵】等，可以在手机应用商店下载并安装这类软件，打开软件选择短信恢复功能并按照提示进行操作，这种方式可以扫描手机中的残余数据，尝试找回已删除的短信。
3、通过荣耀账号同步：如果设置了荣耀账号同步，可以在新手机或重置手机的设置里，找到高级设置选项，选择备份和重置，点击恢复按钮尝试恢复短信。
4、通过第三方服务恢复：部分第三方服务提供商可能提供短信恢复服务，可以在网上搜索并联系这些服务提供商以获取帮助，但请注意，使用第三方服务可能存在风险，务必谨慎操作。
无论采用哪种方法，恢复已删除的短信并不总是成功的，成功率取决于多种因素，如数据被覆盖的程度以及是否已备份等，建议定期备份重要数据以防意外丢失，如果无法自行恢复，建议寻求专业技术人员的帮助。